Dynamique de la transmission de la Fièvre de la Vallée du Rift
# Modèle FVR — Zone Z3, Barkedji (Sénégal)
Modèle multi-agents GAMA de la Fièvre de la Vallée du Rift (FVR / Rift Valley Fever) sur la zone
pastorale Z3 de Barkedji, pour la saison des pluies 2025 (jour de l'année 152 → 334, soit
183 jours simulés).
## 1. Ce que simule le modèle
Trois populations interagissent dans l'espace :
- **Humains** — se déplacent entre campement, mares et troupeaux ; compartiments **S → E → I → R**.
- **Animaux** (bétail) — pâturent, font la transhumance saisonnière, ont une condition corporelle
(NEC) qui pilote leurs déplacements ; compartiments **S → E → I → R** (avec mortalité possible en I).
- **Vecteurs** — moustiques *Aedes* et *Culex* — piquent, transmettent le virus, pondent ;
compartiments **S → E → I** (pas de R : les vecteurs infectés le restent).
La transmission passe uniquement par les vecteurs (pas de contact direct humain/animal). Le moteur
scientifique central est le calcul du **R₀ vectoriel** (formule de Ross-Macdonald), recalculé
toutes les 10 jours simulés, séparément pour *Aedes* seul et pour tous les vecteurs confondus.
Le mécanisme épidémiologique clé de la FVR modélisé ici est la **transmission verticale** (ou
transovarienne) chez *Aedes* : une femelle infectée pond des œufs eux-mêmes infectés
(`rho_aedes`), qui peuvent survivre à la saison sèche dans le sol d'une mare asséchée et éclore
en moustiques déjà infectés dès le retour des pluies — c'est ce mécanisme qui permet au virus de
« redémarrer » chaque saison des pluies sans hôte infecté préexistant.
## 2. Architecture du projet
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Modele_FVR/
├── models/
│ ├── Model_FVR.gaml # point d'entrée : assemble tous les modules ci-dessous
│ ├── core/ # logique globale (pas d'agents spatiaux)
│ │ ├── donnees_chemins.gaml # chemins vers data/, géométrie du monde (shape, zone_z3)
│ │ ├── parametres_globaux.gaml # tous les paramètres/constantes (déclarations pures)
│ │ ├── climat.gaml # chargement du CS …